УДК 633.81:577.113.083: 575.22:004.9
https://doi.org/10.25230/2412-608X-2026-1-205-37-42

1Севиля Бахтияровна Сейтаджиева*
2Саида Заурбиевна Гучетль
2Дмитрий Леонидович Савиченко

1Научно‑исследовательский институт сельского хозяйства Крыма
Россия, 295043, г. Симферополь, ул. Киевская, д. 150

2ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК
Россия, 350038, г. Краснодар, ул. им. Филатова, д. 17
*cepen@mail.ru

Аннотация. Для изучения генетического разнообразия эфиромасличной розы целесообразно применять микросателлитные ДНК‑маркеры, характеризующиеся высокой полиморфностью, кодоминантностью и воспроизводимостью.Цель исследования – разработать микросателлитные маркеры для генотипирования эфиромасличной розы и оценить их эффективность с применением электрофореза в агарозном геле. В работе применяли биоинформатический анализ: на основе эталонного генома Rosa chinensis из базы данных RefSeq (NCBI) с помощью программы GMATA проводили поиск последовательностей, содержащих микросателлитные участки; выравнивали полученные последовательности на геном R. damas-cenа; конструировали SSR-праймеры с помощью инструмента Primer‑BLAST. Применяли стандартные лабораторные методики: выделение ДНК оптимизированным СТАВ-методом; ПЦР с разработанными праймерами при температуре отжига 60 °C и 55 °C; детекция продуктов ПЦР электрофорезом в агарозном геле. Микросателитные маркеры анализировали на сортах коллекции эфиромасличной розы Легрина, Лань, Мичуринка и Романца. Маркеры SSR-локусов из литературных источников не подошли для исследования из-за преобладания в них динуклеотидных повторов и образования нескольких продуктов с близкими по значению размерами. В результате исследований было создано 100 SSR‑маркеров, равномерно распределенных по семи хромосомам R. chinensis. В полученных маркерах преобладали тринуклеотидные мотивы (91 маркер) и длина повтора микросателлитных последовательностей 21 нуклеотид (55 маркеров). Из 100 пар праймеров 79 пар оказались функциональными: 73 пары работали при 60 °C, шесть пар – при 55 °C. Предварительная оценка разработанных SSR-маркеров подтвердила их эффективность для последующего изучения генетического разнообразия эфиромасличной розы.

Ключевые слова: эфиромасличная роза, генетическое разнообразие, ДНК-маркеры, микросателлиты, разработка маркеров, эталонный геном

Финансирование: исследование выполнено в рамках государственного задания № FNZW-2022-0006. В работе использовано оборудование НИЛ «Молекулярная и клеточная биофизика» Института перспективных исследований Севастопольского государственного университета.

Для цитирования: Сейтаджиева С.Б., Гучетль С.З., Савиченко Д.Л. Разработка микросателлитных маркеров для генотипирования эфиромасличной розы российской селекции // Масличные культуры. 2026. Вып. 1 (205). С. 37–42.

Читать статью

Список источников

1. Паштецкий В.С., Невкрытая Н.В., Мишнев А.В., Назаренко Л.Г. Эфиро-масличная отрасль Крыма. Вчера, сегодня, завтра. – 2-е изд., доп. / Под ред. В.С. Паштецкого. – Симферополь: ИТ «АРИАЛ», 2018. – 320 с.

2. Супрун И.И., Плугатарь С.А., Сте–панов И.В., Науменко Т.С. Анализ генетических взаимосвязей генотипов рода Rosa L. из коллекции Никитского ботанического сада с использованием ISSR- и IRAP- ДНК-маркеров // Вави-ловский журнал генетики и селекции. – 2020. – Т. 24. – № 5. – С. 474–480. https://doi.org/10.18699/VJ20.639.

3. Сиволап Ю., Кожухова Н., Кален–дарь Р. Вариабельность и специфичность геномов сельскохозяйственных растений. – Одесса: Астропринт, 2011. – 336 с.

4. Хлесткина Е.К. Молекулярные маркеры в генетических исследованиях и в селекции // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2013. – Т. 17. – № 4/2. – С. 1044–1054.

5. Сухарева А.С., Кулуев Б.Р. ДНК-маркеры для генетического анализа сортов культурных растений // Биомика. – 2018. – Т. 10. – № 1. – С. 69–84.

6. Esselink G., Smulders M., Vosman B. Identification of cut rose (Rosa hybrida) and rootstock varieties using robust sequence tagged microsatellite site markers // Theoreti-cal and Applied Genetics. – 2003. – Vol. 106. – Pp. 277–286. https://doi.org/10.1007/s00122-002-1122-y.

7. Yan Z., Denneboom C., Hattendorf A. [et al.]. Construction of an integrated map of rose with AFLP, SSR, PK, RGA, RFLP, SCAR and morphological markers // Theoretical and Applied Genetics. – 2005. – Vol. 110. – Pp. 766–777.

8. Zhang L.H., Byrne D.H., Ballard R.E., Rajapakse S. Microsatellite marker development in rose and its application in tetraploid mapping // Journal of the American Society for Horticultural Science. – 2006. – Vol. 131. – No. 3. – Pp. 380–387.

9. Kimura T., Nishitani C., Iketani H., Ban Y., Yamamoto T. Development of microsatellite markers in rose // Molecular Ecology Notes. – 2006. – Vol. 6. – No. 3. – Pp. 810–812.

10. Hibrand-Saint Oyant L., Crespel L., Rajapakse S., Zhang L., Foucher F. Genetic linkage maps of rose constructed with new microsatellite markers and locating QTL controlling flowering traits // Tree Genetics & Genomes. – 2008. – Vol. 4. – Pp. 11–23.

11. Meng J., Li D., Yi T., Yang J., Zhao X. Development and characterization of microsatellite loci for Rosa odorata var. gigantea Rehder & EH Wilson (Rosaceae) // Conservation Genetics. – 2009. – Vol. 10. – Pp. 1973–1976.

12. Коллекция эфирномасличных, пряно-ароматических и лекарственных растений (УНУ No 507515): [Электронный ресурс]. – Режим доступа: https://ckp-rf.ru/usu/507515/.

13.Сейтаджиева С.Б., Гучетль С.З., Дидович С.В., Городняя Е.В. Оптимизация методики выделения ДНК для изучения генетического разнообразия эфиро-масличных роз (Rosa L.) // Труды по прикладной ботанике, генетике и селек-ции. – 2024. – Т. 185. – № 3. – С. 191–198.

14.Клименко И.А., Козлов Н.Н., Костенко С.И., Шамустакимова А.О., Мавлютов Ю.М. Идентификация и паспортизация сортов кормовых трав (клевера лугового, люцерны изменчивой, посевной и хмелевидной) на основе ДНК-маркеров (методические рекомендации). – М.: ООО «Угреша Т», 2020. – 35 с.

15. Shinde D., Lai Y.L., Sun F.Z., Arnheim N. Taq DNA polymerase slippage mutation rates measured by PCR and quasi‐likelihood analysis: (CA/GT)(n) and (A/T)(n) microsa-tellites // Nucleic Acids Research. – 2003. – Vol. 3. – No. 3. – Pp. 974–980.

16. Галинская Т.В., Щепетов Д.М., Лысенков С.Н. Предубеждения о микросателлитных исследованиях и как им противостоять // Генетика. – 2019. – Т. 55. – № 6. – С. 617–632.

Сведения об авторах

C.Б. Сейтаджиева, научный сотрудник
С.З. Гучетль, зав. лаб., вед. науч. сотр., канд. биол. наук
Д.Л. Савиченко, научный сотрудник