УДК 633.85:577.21
DOI: 10.25230/2412-608Х-2025-2-202-27-31
Светлана Алексеевна Рамазанова
Елизавета Дмитриевна Логинова
ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК
Россия, 350038, г. Краснодар, ул. им. Филатова, д. 17
molecula.genetic@vniimk.ru
Аннотация. В статье представлены результаты оценки эффективности выделения ДНК из различных частей растений рыжика посевного (Camelina sativa (L.) Crantz) с использованием автоматизированной станции. Цель работы заключалась в адаптации метода экстракции ДНК для получения достаточно качественной ДНК, пригодной для молекулярно-генетических исследований, таких как ПЦР и генетическая паспортизация. В качестве растительного материала использовались сухие семена,
7-дневные проростки и листья рыжика посевного. Выделение ДНК проводили с применением набора реагентов на основе магнитных частиц и автоматической станции. Качество и количество ДНК оценивали с помощью спектрофотометрии и электрофореза в агарозном геле, а её пригодность для ПЦР проверяли с использованием SSR-маркеров. Результаты показали, что наибольший выход ДНК с наименьшим загрязнением был достигнут при выделении из листьев. Однако, несмотря на низкую чистоту образцов, полученных из семян и проростков, все они оказались пригодными для ПЦР-анализа. Для экспресс-диагностики и генетической паспортизации наиболее удобным материалом являются семена, так как они доступны в больших количествах и не требуют дополнительной подготовки. Исследование подтвердило эффективность автоматизированного метода выделения ДНК для генетических исследований рыжика посевного, что особенно важно для масштабных проектов по изучению генетического разнообразия.
Ключевые слова: рыжик посевной, Camelina sativa (L.) Crantz, ДНК, генетическое разнообразие, SSR-маркеры, микросателлиты, автоматизированное выделение ДНК, ПЦР
Для цитирования: Рамазанова С.А., Логинова Е.Д. Оценка эффективности выделения ДНК из разных частей растений рыжика посевного Camelina sativa (L.) Crantz // Масличные культуры. 2025. Вып. 2 (202). С. 27–31.
Список литературы
1. Aboul-Maaty N.A., Oraby H.A.S. Extraction of high-quality genomic DNA from different plant orders applying a modified CTAB-based method // Bulletin of the National Research Centre. – 2019. – Vol. 43. – Art. No. 25. DOI: 10.1186/s42269-019-0066-1.
2. Doyle J.J., & Doyle J.L. Isolation of plant DNA from fresh tissue // Focus. – 1990. – Vol. 12. – P. 13–15.
3. Khanuja S.P.S., Shasany A.K., Darokar M.P., Kumar S. Rapid isolation of DNA from dry and fresh samples of plants producing large amounts of secondary metabolites and essential oils // Plant Molecular Biology Reporter. – 1999. – Vol. 17. – No. 1 – P. 1–7. DOI: 10.1023/A:1007528101452.
4. Moreira P.A., Oliveira D.A. Leaf age affects the quality of DNA extracted from Dimorphandra mollis (Fabaceae), a tropical tree species from the Cerrado region of Brazil // Genetics and Molecular Research. – 2011. – Vol. 10. – No. 1. – Р. 353–358. DOI: 10.4238/vol10-1gmr1030.
5. Porebski S., Bailey L.G., Baum B.R. Modification of a CTAB DNA extraction protocol for plants containing high polysaccharide and polyphenol components // Plant Molecular Biology Reporter. – 1997. – Vol. 15 – No. 1.– Р. 8–15.
6. Scott K.D., Playford J. DNA extraction technique for PCR in rain forest plant species // BioTechniques. – 1996. – Vol. 20. – No. 6. – P. 974–978.
7. Saghai-Maroof M.A., Soliman K.M., Jorgensen R.A., Allard R.W. Ribosomal DNA spacer-length polymorphisms in barley: Mendelian inheritance, chromosomal location, and population dynamics // Proc. of the National Academy of Sciences. – 1984. – Vol. 81. – No. 24. – P. 8014–8018.
8. Fu Y.B., Peterson G.W., Richards K.W. Genetic diversity analysis of Camelina sativa (L.) Crantz using SSR markers // Genetic Resources and Crop Evolution. – 2017. – Vol. 64. – No. 2. – P. 361–370.
9. Омашева М.Е., Пожарский А.С., Смайлов Б.Б., Галиакпаров Н.Н. Молекулярно-генетическая паспортизация сортов яблони: научно-методические рекомендации. – Алматы, 2017. – 50 с.
Сведения об авторах
С.А. Рамазанова, вед. науч. сотр., канд. биол. наук
Е.Д. Логинова, мл. науч. сотр., аспирант