УДК 633.853.52:631.522
DOI: 10.25230/2412-608Х-2024-2-198-10-15
Виолетта Георгиевна Савиченко
Светлана Алекеевна Рамазанова
Саида Заурбиевна Гучетль
ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК
Россия, 350038, г. Краснодар, ул. им. Филатова, д. 17
psld.leta@mail.ru
Реферат. Соя является важной культурой в обеспечении продовольственной безопасности страны. Создание новых сортов сои и включение их в Госреестр будет сопровождаться генетической паспортизацией. Целью исследования стал поиск информативных SSR-локусов для дополнения существующей системы ДНК-маркеров для паспортизации сои. Из базы данных SoyBase с помощью онлайнинструмента Primer-BLAST отобрали 27 SSR-локусов. Информативность микросателлитных локусов была оценена на 20 сортах сои. ПЦР-продукты разделяли в ПААГ в денатурирующих условиях. Из 27 отобранных in silico микросателлитных локусов были выбраны 13 высокоинформативных (PIC 0,50–0,72) и пять информативных (PIC 0,44–0,49). Отобранные в результате настоящего исследования микросателлитные локусы могут быть использованы для генотипирования и, совместно с апробированными нами ранее ДНК-маркерами, для паспортизации сортов сои.
Ключевые слова: соя, Glycine max (L.), идентификация, паспортизация, ДНК-маркеры, микросателлиты, SSR
Для цитирования: Савиченко В.Г., Рамазанова С.А., Гучетль С.З. Поиск информативных SSR-маркеров для паспортизации сортов сои // Масличные культуры. 2024. Вып. 2 (198). С. 10–15.
Список литературы
1. SoyStats: [Электронный ресурс]. – Режим доступа: http://soystats.com/international-world-oilseed-production/ (дата обращения: 13.02.2024).
2. FAOSTAT: [Электронный ресурс]. – Режим доступа: https://www.fao.org/faostat/ru/ (дата обращения: 13.02.2024).
3. Федеральный закон от 30.12.2021 (в ред. 04.08.2023) № 454-ФЗ «О семеноводстве» // Собрание законодательства РФ (ч. I). – 03.01.2022. – № 1. ст. 23.
4. Zatybekov A., Yermagambetova M., Genievs-kaya Y., Didorenko S., Abugalieva S. Genetic diversity analysis of soybean collection using simple sequence repeat markers // Plants. – 2023. – 12. – 3445. DOI: 10.3390/plants12193445.
5. Gupta S.K., Manjaya J.G. Genetic diversity and population structure of Indian soybean [Glycine max (L.) Merr.] revealed by simple sequence repeat markers // Journal of Crop Science and Biotechnology. – 2017. – No 20. – P. 221–231. DOI: 10.1007/s12892-017-0023-0.
6. Гайнуллина К.П., Кулуев Б.Р., Давлетов Ф.А. Оценка генетического разнообразия сортов и линий гороха с помощью SSR-анализа // Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции. – 2020. – № 181 (3). – С. 70–80. DOI: 10.30901/2227-8834-2020-3-70-80.
7. Ильницкая Е.Т., Макаркина М.В., Степанов И.В., Супрун И.И., Токмаков С.В., Айба В.Ш., Авидзба М.А., Котляр В.К. Генетический полиморфизм аборигенных абхазских сортов винограда // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2021. – 25 (8). – С. 797–804. DOI: 10.18699/VJ21.092.
8. Колобова О.С., Малюченко О.П., Шалаева Т.В., Шанина Е.П., Шилов И.А., Алексеев Я.И., Велишаева Н.С. Генетическая паспортизация картофеля на основе мультиплексного анализа 10 микросателлитных маркеров // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2017. – № 21 (1). – С. 124–127. DOI: 10.18699/VJ17.230.
9. Канукова К.Р., Газаев И.Х., Сабанчиева Л.К., Боготова З.И., Аппаев С.П. ДНК-маркеры в растениеводстве // Известия Кабардино-Балкарского научного центра РАН. – 2019. – № 6 (92). – С. 220–232.
10. Савиченко В.Г., Рамазанова С.А. Идентификация сортов сои (Glycine max L.) селекции ВНИИМК методом микросателлитного анализа // Сб. мат-лов 11-й Всероссийской конф. молод. уч. и спец. «Актуальные вопросы биологии, селекции, технологии возделывания и переработки сельскохозяйственных культур». – Краснодар, 2021. – С. 97–101.
11. Савиченко В.Г. Идентификация сортов сои на основе полиморфизма SSR-маркеров // Научные труды Северо-Кавказского федерального научного центра садоводства, виноградарства, виноделия. – 2023. – Т. 37. – С. 68–72.
12. SoyBase. Integrating Genetics and Genomics to Advance Soybean Research [Электронный ресурс]. – Режим доступа: https://soybase.org/ (дата обращения: 21.01.2024).
13. Primer-BLAST: [Электронный ресурс]. – Режим доступа: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/ primer-blast (дата обращения: 21.01.2024).
14. Ye J., Coulouris G., Zaretskaya I. [et al.]. Primer-BLAST: A tool to design target-specific primers for polymerase chain reaction // BMC Bioinformatics. – 2012. – Vol. 13. – Art. No. 134. DOI: 10.1186/1471-2105-13-134.
Сведения об авторах
В.Г. Савиченко, млад. науч. сотр.
С.А. Рамазанова, вед. науч. сотр., канд. биол. наук
С.З. Гучетль, зав. лаб., вед. науч. сотр., канд. биол. наук