УДК 633.853.494:631.527
https://doi.org/10.25230/2412-608X-2025-3-203-6-12

Саида Заурбиевна Гучетль*

ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК
Россия, 350038, г. Краснодар, ул. им. Филатова, д. 17
*saida.guchetl@mail.ru

Аннотация. Озимый и яровой рапс (Brassica napus L.) является одной из важнейших масличных, кормовых, сидеральных и медоносных культур в Российской Федерации. Для анализа генетического разнообразия селекционного материала и разработки генетических паспортов сортов и гибридов рапса необходима эффективная методика генотипирования на основе молекулярных маркеров. Данное исследование направлено на оценку пригодности известных SSR-маркеров для решения этих задач. Работа проведена в лаборатории молекулярно-генетических исследований ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК. В качестве материала использовали 5–7-дневные проростки 20 линий рапса озимого селекции ВНИИМК. Амплификация ДНК выполнена с 15 парами опубликованных SSR-праймеров; детекцию фрагментов ДНК проводили методом электрофореза в 8 % денатурирующем полиакриламидном геле. Результаты показали, что маркеры в половине случаев выявляли локусы, присутствующие одновременно на обоих субгеномах рапса. Преобладали маркеры с динуклеотидными мотивами и участками низкой сложности; некоторые демонстрировали доминантный тип наследования. Всего идентифицировано 23 маркерных локуса. Из них пять локусов оказались мономорфными. Два маркера демонстрировали множественные неспецифичные или нечеткие фрагменты ДНК. Оставшиеся 16 маркеров выявили полиморфизм в пределах изученной группы образцов: число аллелей (na) варьировало от 2 до 4, эффективное число аллелей (ne) – от 1,1 до 3,76, индекс полиморфного информационного содержания (PIC) – от 0,09 до 0,55. Дискриминационный потенциал системы маркеров был умеренным. Испытанные маркеры позволили дифференцировать все изученные образцы рапса. Однако, в основном, данные маркеры не удовлетворяют критериям, необходимым для разработки технологии генетической паспортизации рапса. Поиск оптимальных маркеров будет продолжен.

Ключевые слова: рапс, Brassica napus L., микросателлиты, ДНК, маркеры, апробирование, генотипирование

Благодарность: автор выражает благодарность заведующему отделом селекции рапса и горчицы Горловой Л.А. и заведующему лабораторией селекции гибридов рапса Стрельникову Е.А. за предоставленные семена линий.

Для цитирования: Гучетль С.З. Оценка применимости известных SSR-маркеров для создания молекулярно-генетических паспортов селекционного материала рапса ВНИИМК // Масличные культуры. 2025. Вып. 3 (203). С. 6–12.

Читать статью

Список источников

1. Анискина Ю.В., Матвеев А.Н., Хорьков Е.И., Шилов И.А., Харченко П.Н. Генотипирование сортов ярового рапса методом анализа полиморфизма микросателлитов // Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук. – 2007. – № 5. – С. 12–14.

2. Рогожина Т.Г., Анискина Ю.В., Карпачев В.В., Шилов И.А. Использование микросателлитного анализа для выявления биотипов у сортов ярового рапса (Brassica napus L.) // Масличные культуры. – 2015. – № 2 (162). – С. 27–33.

3. Клименко И.А., Воловик В.Т., Антонов А.А. [и др.]. Изучение генетического полиморфизма российских сортов рапса и сурепицы с использованием SSR- и SRAP-маркеров // Вавиловский журнал генетики и селекции. – 2022. – Т. 26. – № 4. – С. 349–358. https://doi.org/10.18699/VJGB-22-42.

4. Zhu J., Zhang J., Jiang M. [et al.]. Development of genome-wide SSR markers in rapeseed by next generation sequencing // Gene. – 2021. – V. 798. – Iss. 6199. – Art. No. 145798. https://doi.org/10.1016/j.gene.2021.145798.

5. Горлова Л.А., Бочкарева Э.Б., Сердюк В.В., Стрельников Е.А. Сорт рапса ярового Баланс // Масличные культуры. – 2022. –
№ 4 (192). – C. 110–112.

6. Бочкарева Э.Б., Горлова Л.А., Сердюк В.В., Стрельников Е.А., Ефименко С.Г. Сорт высокоолеинового рапса озимого Оливин // Масличные культуры. – 2020. – № 2 (182). – С. 154–157.

7. Горлова Л.А., Бочкарева Э.Б., Сердюк В.В., Стрельников Е.А. Ранний сорт рапса озимого Актив // Масличные культуры. – 2024. – № 3 (199). – С. 102–105. https://doi.org/
10.25230/2412-608X-2024-3-199-102-105.

8. Бочкарева Э.Б., Горлова Л.А., Стрельников Е.А., Сердюк В.В. Первый отечественный гибрид рапса озимого Дебют // Масличные культуры. – 2021. – № 2 (186). – С. 98–100.

9. Hammer O., Harper D.A.T., Ryan P.D. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica. – 2001. – V. 4 (1). – Pp. 1–9.

10. Сатина Т.Г., Анискина Ю.В., Карпачев В.В., Шилов И.А., Харченко П.Н. Идентификация сортов рапса методом микросателлитного анализа // Доклады Российской академии сельскохозяйственных наук. – 2010. – № 1. – С. 11–13.

Сведения об авторах

С.З. Гучетль, зав. лаб., вед. науч. сотр., канд. биол. наук